La transformation de Baños de la Reina en lieu de culte chrétien se reflète dans la construction d'une église primitive et d'une nécropole ad sanctus sur une partie de la maison 1.
A l'ouest, au pied de l'église, un baptistère indépendant a été construit. Il a la forme d'une croix grecque et est recouvert de mortier d'opus signinum, avec une marche descendante dans chacun de ses bras.
La délimitation de l'église coïncide avec la disposition de la salle nord de la maison 1, ce qui fait qu'elle profite de son exèdre central et de son pavement en marbre. Au-dessus, deux sarcophages en pierre disposés du nord au sud témoignent du caractère sacré de l'enceinte.
Des éléments tels qu'une colonne de granit et les seuils en calcaire micritique représentent certains des matériaux transformés et réutilisés dans cet édifice religieux.