Die Umwandlung von Baños de la Reina in einen Ort christlicher Anbetung spiegelt sich im Bau einer primitiven Kirche und einer Nekropole ad sanctus über einem Teil von Haus 1 wider.
Im Westen, am Fuße der Kirche, wurde ein freistehendes Baptisterium errichtet. Es hat die Form eines griechischen Kreuzes und ist mit Opus-Signinum-Mörtel bedeckt, wobei in jedem seiner Arme eine Stufe nach unten führt.
Die Abgrenzung der Kirche stimmt mit dem Grundriss des Nordraums von Haus 1 überein, was bedeutet, dass sie dessen zentrale Exedra und Marmorboden nutzt. Darüber zeigen zwei von Norden nach Süden angeordnete Steinsarkophage die Heiligkeit des Bereichs.
Elemente wie eine Granitsäule und die Schwellen aus Mikritkalkstein stellen einige der Materialien dar, die in diesem religiösen Gebäude umgewandelt und wiederverwendet wurden.